Compllexattiion de TCDD par lla molléculle Hôtte--iinviitté cucurbiitt ((n)) uriills :: éttude Sttructturalle ett énergéttiique par lles métthodes Quanttiiques
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Date
2022
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Publisher
Faculté des Sciences
Abstract
Ces derniers temps de nombreux groupes de recherche de diverses disciplines (synthèse organique, biochimie, chimie supramoléculaire etc.…) ont marqué des progrès significatifs dans l’étude des grands systèmes moléculaires.
La chimie supramoléculaire a connu un essor considérable au cours de ces deux dernières décennies. Cette chimie est basée sur des interactions entre molécules où aucune liaison covalente n’est établie entre les espèces qui interagissent. Une définition bien adaptée à cette discipline a ainsi été donnée par Jean-Marie Lehn. [1.2]
La chimie supramoléculaire est domaine interdisciplinaire de la science impliquant les caractéristiques chimiques, physiques et biologiques des assemblages moléculaires ayant une plus grande complexité que les molécules individuelles .elle étudie les structures des systèmes qui résultent des interactions intermoléculaires de deux ou plus entités chimiques.
La chimie supramoléculaire est alors définie comme « la chimie des assemblages de molécules et des liaisons intermoléculaires » ou « la chimie au-delà de la molécule individuelle ». Elle peut être regroupée en deux grande familles des complexes de type récepteur-substrat et les complexe de type hôte-invité et ce dernier nous s’intéresse, plus particulièrement, dans ce travail.
Communément l’hôte (molécule cage) est une molécule de grande taille (enzymes, composés cycliques, ...) capable de stabiliser un invité (du simple cation monoatomique jusqu’à la protéine ou la chaîne d’un polymère).
Les cucurbiturils (CBn) est une famille (hôtes) macrocycliques obtenus facilement par une réaction de condensation catalysée par un acide de glycori l et de formaldéhyde, formant des oligomères cycliques de n unités glycoluriles pontées par 2n groupes méthylène. Behrend et ses collaborateurs ont commencé leur synthèse en 1905 (nommée polymère de Behrend) [3].
L’encapsulation dans les cucurbiturils est gouvernée par des interactions non covalentes entre les molécules invitées et la molécule hôte. Pour étudier la géométrie et identifier les différentes interactions entre ces deux partenaires la modélisation moléculaire présente un grand intérêt dans l’étude des complexes d’inclusion. [4]
Introduction générale
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Le but de ce mémoire est d’étudier les complexes d’inclusion formés de TCDD avec la molécule cage la Cucurbite(n)uril. Cette étude est basée sur des méthodes de la chimie théorique à l’aide des logiciels (Gaussian, ChemBioffice, MOPAC, Origine) afin de déterminer les géométries les plus stables, les propriétés électroniques, les interactions non covalentes responsables à la stabilité des complexes d’inclusion