Etude de la résistance aux β-lactamines des Entérobactéries responsables des maladies infectieuses dans la wilaya de Skikda
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Date
2024
Authors
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Publisher
université 20 aout 1955
Abstract
Les entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération (E-RC3G)
suscitent une préoccupation grandissante en raison de leur prévalence croissante, en
particulier en pays en développement, notamment en Algérie. Cette étude vise à étudier les
déterminants de la résistance aux céphalosporines de troisième génération (C3G) et les
facteurs de virulence qui leur sont associés, en milieu hospitalier et communautaire à la
wilaya de Skikda. Des souches d'E-RC3G sont collectées au laboratoire de microbiologie de
l'hôpital Abderrezek Bouhara ainsi qu'à partir de différents laboratoires cliniques privés (LCP)
situés à Skikda, durant une période allant d'octobre 2020 à juin 2022. L'identification et la
sensibilité aux antibiotiques sont confirmées au moyen du Système VITEK 2. La recherche de
la production de β-lactamases à spectre élargi (BLSE) ainsi que la production de
carbapénèmase chez les souches résistantes au carbapénème ont été déterminées par un
ensemble de tests phénotypiques (Antibiogramme) et génotypiques (PCR et sequençage). Les
souches Escherichia coli étaient classées en phylogroupes, génotypées en utilisant la Eric
PCR, et les gènes de virulence étaient recherchés par PCR. Au total, 82 E-RC3G sont
collectées, 37 provenant de l'hôpital et 45 des LCP, principalement E. coli et Klebsiella
pneumoniae. La majorité (67 %) des isolats provenaient d’infections urinaires. Un taux élevé
des souches (69,5 %) étaient multirésistantes. Les souches des patients externes (PE)
présentaient des profils de résistance aux antibiotiques comparables à ceux des souches des
patients hospitalisés (PH). La plupart des E-RC3G (87 %) étaient productrices de BLSE, avec
une prédominance du gène blaCTX-M (96 %). Les gènes codant l’AmpC sont détectés chez 7
souches, dont 5 portaient blaCMY et 2 blaDHA. Parmi les 15 entérobactéries productrices de
carbapénèmase (CPE), le type NDM (NDM-1 et NDM-5) était prédominant, présent chez 87
% des isolats. Les types OXA-48 et OXA-244 ont chacun été détectés chez un isolat de PE.
Les isolats d'E. coli de PH appartenaient principalement au phylogroupe A, tandis que ceux
des PE étaient majoritairement du phylogroupe B2. Les gènes de virulence étaient plus
fréquents chez les souches des PE, à l'exception de fyuA, traT, feoB et irp2, plus prévalent
chez les souches hospitalières, Cependant, seul fyuA y était associé de manière significative,
tandis que yadN et chuA étaient spécifiquement liés aux PE. Le génotypage a révélé des liens
clonaux à 60 % entre certaines E. coli de l'hôpital et des LCP. L'émergence des E-RC3G
virulentes et co-résistantes aux carbapénèmes en milieu hospitalier et communautaire à
Skikda représente un défi thérapeutique majeur. Cette étude est la première réalisée à Skikda
pour caractériser ces isolats en explorant leurs mécanismes de résistance et leurs facteurs de
virulence. Cette situation souligne l'urgence d'une surveillance continue dans ces deux milieux
pour limiter leur propagation